如何选定qPCR实验用纯水仪?
目前疫情的防控工作取得了阶段性的成效,基于实时荧光定量PCR的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。
什么是实时荧光定量PCR?
实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)技术,简称qPCR,是在PCR反应体系中加入荧光物质(荧光染料或荧光标记的特异性探针),利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
与普通PCR相比,实时荧光定量PCR技术是一次由定性技术向定量技术的飞跃。运用该项技术,可以对DNA、RNA样品进行相对定量、绝对定量和定性分析。
实验流程:
在实时荧光定量PCR实验中,可以分为样本采集,RNA提取,RNA质量鉴定,反转录及数据分析几个步骤,在进行引物、模板的稀释,试剂的配制和补足反应体系时都会用到水,水质量的好坏直接影响最终数据分析的结果。
水中的颗粒物,离子含量,有机物及细菌微生物等杂质对实验都会带来影响,最值得关注的因素有以下两个方面:
1. DNA酶和RNA酶
DNA酶和RNA酶能够特异性地降解DNA和RNA。在进行实时荧光定量PCR时,去除这两种酶从而保证提取的RNA和DNA样本的完整性十分关键。尤其在提取RNA的时候,RNA极易被降解。这是因为RNase非常稳定,且无处不在,用常规的高温高压蒸汽方法和蛋白酶抑制剂不能使所有的RNase完全失活。如果样本中的核酸被降解,会影响检测结果的准确性,甚至造成假阴性检测结果。
因此,实时荧光定量PCR实验用超纯水必须有效降低DNA酶和RNA酶的含量,减少对实验的影响。
2. 镁离子
实时荧光定量PCR实验需要根据不同的引物对和模板确定最佳的镁离子浓度。
Mg2+浓度过低,会影响DNA聚合酶的活性,导致产量降低,影响实时定量的敏感性;
Mg2+浓度过高,会增加引物二聚体的形成,这会影响特异性。
因此,实时荧光定量PCR实验用超纯水必须控制Mg2+浓度,避免背景因素带来的不确定性。
综上,实时荧光定量PCR实验推荐使用超纯水,水质要求如下图所示:
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