实验室设施需要考察到实验动物的安全与健康，并以降低实验上的变异性为目标，以达到适合的研究环境。以此，实验动物笼子大小、寝垫、喂食、环境因子(光线、温度、湿度、空气质量)都应小心控管。

虽在某些时候自来水可用于实验动物饮用，但因自来水的成份可能随着时间或季节而不同和不同地域的自来水可能造成实验室结果的差异。因此，为了得到具再现性及可靠的实验结果，提供质量稳定的实验动物饮用水便相当重要。另外，有些实验动物(如免疫实验用动物)，或是用于疾病模型的动物，其对于生长环境更加敏感，更需要高纯度的动物饮用水。

实验动物饮用水应去除以下污染物：

有机物质

有些有机物质，如杀虫剂、内分泌破坏剂，可能存在于自来水中，不但会影响实验动物的健康，更会干扰研究的进行。另外，若水中还有氯，有机物可能形成，进而有致癌或影响动物生殖的后果。有机物有时可能成为细菌的养份，进而促进细菌的生长。通常，有机物可以用活性碳或反渗透的方法加以去除。

细菌

细菌可能造成实验动物的严重健康问题，故为实验动物相关设备最注重的考察因素。免疫不全动物及基因克隆动物尤其对细菌污染特别敏感。举例来说，一株常发现存在于水中的菌种，即会危害较脆弱动物的健康状况。水中的细菌含量亦可靠反渗透的方式降低。

重金属

高浓度的重金属(如铜、铁、锌、铅等)，对健康不全实验动物可能是有毒性的。这些重金属可能由管线中释出。水中的离子及金属可由反渗透的方式大幅去除。

硬水及水中颗粒

硬水及水中的颗粒可能破坏自动供水系统的阀门，并造成动物笼内的漏水。供水系统的保养维护需求相对也会提高。

氯消毒

此法被普遍的采用，但是需要控制纯水的pH值，因为氯消毒在高pH值的环境中效果较低。在氯消毒时，可被接受的自由氯浓度为介于5~12 ppm之间。

酸化消毒

相较于氯消毒，酸化是一个较稳定且可于系统中持续较久的方法，然而缺点是需要一并使用抗腐蚀剂。另外，pH值需调整为2.6~3才能有较佳效果，不过，动物可能因味道不佳而抗拒饮用pH值低于2~5以下的水。

总之，在实验动物饮用水的纯化上，反渗透纯水是最被推荐的，因为此方法可去除水中大部分的有机物及离子，进而提供一稳定的纯水质量。自来水中的污染物成份会随时间及季节有所不同，故不宜用于实验动物的饮用水。经离子交换树脂纯化的去离子水，可能仍然含有有机物及微生物，故亦不建议使用于实验动物饮用水。